PENENTUAN AKTIVITAS SENYAWA TURUNAN MANGIFERIN SEBAGAI ANTIDIABETES PADA DIABETES MELLITUS TIPE 2 SECARA IN SILICO DETERMINATION OF MANGIFERIN DERIVED COMPOUNDS AS ANTIDIABETIC FOR TYPE 2 DIABETES MELLITUS WITH IN SILICO

Muazah Wahyu Pujiastuti

Abstract


Abstrak. Target molekular yang banyak diteliti saat ini sebagai antidiabetes pada diabetes mellitus tipe 2 dalam menstimulasi translokasi GLUT4 ke membran sel adalah PTP 1B ( Protein Tyrosine Phosphatase-1b). PTP1B merupakan regulator negatif pada sinyal insulin yang dapat mendefosforilasi insulin reseptor dan berakibat pada resistensi insulin sehingga harus dilakukan penghambatan terhadap aktifitasnya. Mangiferin mempunyai efek antidiabetes tipe 2 sehingga dilakukan penambatan molekul pada 10 senyawa mangiferin dan turunannya terhadap PTP-1B. Penambatan Molekular merupakan metode komputasi yang bertujuan meniru peristiwa interaksi suatu molekul ligan dengan protein yang menjadi targetnya pada uji in-vitro. Penambatan molekul senyawa mangiferin dan turunannya dengan PTP-1B menghasilkan nilai score docking dan konstanta inhibitor. Software yang digunakan pada penambatan molekul yaitu Autodock Tool 4.2, Chem Bio 3D dan Pymol 4.0. Hasil penambatan molekul dari 10 senyawa mangiferin dan turunannya menunjukkan bahwa senyawa mangiferin memiliki afinitas pengikatan dan konstanta penghambatan masing –masing sebesar -4,6 Kkal/mol dan 423,81 mM. Nilai afinitas yang rendah membuktikan bahwa senyawa mangiferin dapat berikatan dengan sisi aktif PTP-1B dan menghambat aktivitasnya walaupun ikatan yang dihasilkan kurang stabil sehingga perlu dilakukan sintesis turunan mangiferin yang dapat menambah kestabilan pengikatan dan penghambatan terhadap PTP-1B. Pada senyawa mangiferin terjadi interaksi melalui ikatan hidrogen dengan residu asam amino dari PTP-1B yaitu GLN-78, ARG-79 dan LYS-73. Residu asam amino tersebut merupakan daerah katalitik pada protein PTP-1B.


Kata kunci : Senyawa mangiferin dan turunannya, Penambatan Molekul, PTP1B


 


Abstract. Many studied of molecular target today as antidiabetic of type 2 diabetes mellitus in stimulating GLUT4 translocation to cell membranes is PTP 1B (Protein Tyrosine Phosphatase-1B). PTP1B is a negative regulator of insulin signals that can dephosphorylated insulin receptors and result in insulin resistance and should be inhibited against its activity. Mangiferin has the effect of type 2 antidiabetes so that molecular docking is done on 10 mangiferin compounds and their derivatives to PTP-1B. Molecular docking is a computational method that aims to mimic the interaction event of a ligand molecule with a protein targeted for in vitro tests. The molecular docking of the mangiferin compounds and their derivatives with PTP-1B results in a score of docking and inhibitor constants. Software used in molecular docking is Autodock Tool 4.2, Chem Bio 3D and Pymol 4.0. The molecular docking results of the 10 mangiferin compounds and their derivatives show that mangiferin compounds having the bonding affinity and inhibitory constants respectively of -4,6 Kkal / mol and 423,81 mM. The low affinity value proves that the mangiferin compound can bind to the active side of PTP-1B and inhibit its activity even if the resulting bond is less stable so it is necessary to synthesize mangiferin derivatives which can increase the stability of binding and inhibition of PTP-1B. The low affinity value in the mangiferin compound there is interaction through hydrogen bonds with amino acid residues of PTP-1B ie GLN-78, ARG-79 and LYS-73. The amino acid residue is the catalytic region of the PTP-1B protein


Keywords: Mangiferin compounds and their derivatives, Molecular Docking, PTP1B


Full Text: PDF

Refbacks

  • There are currently no refbacks.